Metody badania CUN dzieli się na strukturalne oraz funkcjonalne. Metody strukturalne pokazują struktury narządu, natomiast metody funkcjonalne dostarczają informacji o metabolizmie tkanki mózgowej. Do metod strukturalnych zaliczana jest:

• tomografia komputerowa,
• nuklearny rezonans magnetyczny,
• angiografia.

Do metod funkcjonalnych należy:

• funkcjonalny rezonans magnetyczny,
• tomografia emisyjna pojedynczego fotonu,
• pozytronowa emisyjna tomografia,
• metoda elektroencefalografii EEG,
• metoda potencjałów wywołanych.

Metody badania pracy mózgu: elektroencefalografia EEG, tomografia komputerowa głowy, rezonans magnetyczny oraz metoda potencjałów wywołanych są najbardziej przydatne w badaniach z obszaru logopedii i pedagogiki specjalnej.

Badanie EEGumożliwia poznane zmian czynności mózgu charakterystycznych dla różnych dysfunkcji w obrębie ośrodkowego układu nerwowego: zaburzenia neurorozwojowe, choroby psychiczne i neurologiczne. Charakterystyczne zmiany w zapisie EEG obserwuje się m.in. w ADHD, zaburzeniach ze spectrum autyzmu, padaczce, dysleksji, chorobie Alzheimera.

Tomografia komputerowajest metodą stosowaną w diagnostyce stanów chorobowych mózgowia, móżdżku, pnia mózgu, twarzoczaszki. Jest pomocna w procesie diagnozowania i obrazowania m.in. wrodzonych zaburzeń budowy CUN, udaru mózgu, krwotoków mózgowych, guzów mózgu, urazów i infekcji.

Jedną z najnowszych metod diagnostycznych jest rezonans magnetyczny. Pozwala na obrazowanie anatomii, zmian patologicznych, metabolizmu oraz przepływów naczyniowych w obrębie CUN. Metoda ta jest pomocna w diagnozowaniu chorób demielinizacyjnych, chorób otępiennych, nowotworów, guzów, udarów, zmian popromiennych i urazów.

Badanie potencjałów wywołanychjest metodą badania przewodzenia w układzie nerwowym. Za jego pomocą bada się w jaki sposób impuls jest przewodzony przez drogę nerwową. Metodę tę stosuje się w diagnostyce zaburzeń zmysłowych: wzroku, słuchu, somatosensoryki, a także zaburzeń czuciowych i ruchowych. Badanie potencjałów wywołanych obejmuje także ocenę czynności neuronalnych związanych z procesami poznawczymi, psychologicznymi, pamięci i stopnia skupienia uwagi.